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crispr/cas9文库基因筛选综合服务

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提供商:
派致生物
服务名称:
crispr/cas9文库基因筛选综合服务
规格:
定制

技术背景

       在后基因组时代基因芯片和二代测序技术可以高通量筛选不同样本间的差异基因,但无法有效判断差异基因的功能或基因与表型的关系。利用功能缺失(loss-of-function)或功能获得(gain-of-function)高通量筛选策略,可帮助研究者快速高效地筛选出在特定表型中发挥关键作用的基因,为深入了解疾病发生发展的机制和新药的开发提供重要思路。

       目前可用于高通量功能筛选的技术有rnai(rna干扰)crisprko(crispr knock-out) crispra( crispr activation)crispri(crispr interference),每个技术都各有优缺点,可根据不同需要进行选择。其中crisprko同时覆盖编码基因和非编码基因,脱靶率低,技术成熟稳定,应用广泛。

crispr文库筛选原理及步骤

       针对待筛选基因中的每个基因设计sgrna,可获得覆盖全基因组的寡核酸(sgrna)文库,将所有sgrna构建到慢病毒载体上并包装慢病毒,以低moi值感染表达系统其它元件的细胞,可获得理论上每个细胞单基因功能缺失细胞库。通过特定表型或报告基因的筛选获得目的细胞,经高通量测序及分析即可获得与筛选条件高度相关的候选基因。


crispr文库筛选步骤montalbano,a.et al,mmolecular cell 2017

文库选择
 
文库名称 物种 覆盖范围 载体类型
gecko v2
human library
human 19,050个编码基因(每基因6sgrna) 1864mirna(mirna 4sgrna) 1000control sgrna,共计122411sgrna 慢病毒双载
crispr/cas9 sgrna定制文库 可选择 根据需要定制lncrna、细胞凋亡、细胞增殖、信号通路、核受体相关等文库 慢病毒单载或双载可选择

可选择筛选表型

1、细胞耐药筛选
2、细胞增殖筛选
3、细胞凋亡筛选
4、细胞信号通路筛选

文库应用

1、筛选表型相关关键基因或信号通路,研究表型调控机制。
2、筛选肿瘤治疗潜在靶点,研发新药。
3、筛选耐药或增敏基因,开发新的联合用药方案。

服务流程


          筛选表型及文库类型确认→sgrna文库合成并构建→sgrna文库慢病毒包装病毒感染目的细胞筛选感染阳性细胞表型筛选高通量测序分析并确定基因列表






 
         派致生物专注于基因编辑技术的开发与应用,并致力于为临床和基础研究人员提供专业、全面的crispr文库基因筛选定制服务。







 
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