10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案价格-博天堂备用

受到新冠肺炎的影响，很多人不能返回工作岗位，每天呆在家里，刷着疫情的数字和满天飞的各种言论，时而感动时而气愤时而焦虑。。。小编想说的是，疫情终将是会过去的，并且不会让我们等太久！生活依然还得继续，那么在这段在家养精蓄锐的日子里，我们不妨认真的规划一下未来的生活和工作。比如，对于科研工作者来说，有什么新颖的技术可以助力自己的科研成果再上一个台阶呢？
今天，小编要再次隆重的为您介绍一下这个新鲜出炉，热气腾腾的新技术——10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案。

 为什么要进行空间转录组的研究？ 

空间转录组，顾名思义，是指可以捕获组织切片中，带有空间位置信息的全转录组表达，简单点，就是我们可以知道组织上的某个点究竟有哪些基因在表达。这有什么重要的意义呢？举个例子：如下图所示，是两个乳腺癌患者的肿瘤组织切片，根据每个点的基因表达情况，确认红色的点是免疫细胞。在a图中，我们可以看到，免疫细胞浸润在整个组织切片中，这样的患者预后效果就比较好；而b图中，免疫细胞只存在于肿瘤组织边缘，这样的患者预后效果就比较差。但是，如果我们不进行空间转录的研究，即使是做了单细胞转录组，由于没有细胞的空间位置信息，我们依然不能反映出样本最真实的状态！所以空间转录组可以补充单细胞基因表达在空间信息上的空白。

图片来源：saltz et al. cellreports, may 2018

 目前空间转录组应用的领域 


 10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案的特征 

 10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案的技术原理 

10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案的技术核心就在这张小小的载玻片上，每张载玻片上有四个捕获区域（6.5x6.5 mm），每个捕获区域里有5000个被条形码标记的点（barcoded spots），点的直径为55μm，（相邻两点之间中心到中心的距离为100μm），每个点都有一个独特的条形码序列。当rna从组织切片的细胞中释放出来后，迁移到每个点的rna会被标记上相应的条形码序列，然后进行文库构建并进行测序。接下来，根据数据的条形码信息对数据进行分配，以确定哪些数据来自哪个位置。最终实现空间基因表达的可视化。

 10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案工作流程 

 10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案结果展示 

图 小鼠大脑中空间分辨率的表达及聚类

a.对小鼠大脑切片进行h＆e染色，成像，然后通过10x genomics公司visium空间基因表达博天堂备用的解决方案工作流程进行处理；b.展示了含有umi计数的数据与组织空间位置的图像叠加；c.总基因计数；d.基于总差异表达基因的空间naïve聚类（spatially naïve clustering）。最右边显示了相比于其他细胞簇，在细胞簇4（绿色）中高表达的基因。

图 小鼠大脑中空间分辨率的基因表达

a.h＆e染色小鼠冠状脑组织切片；基因 （b）和基因 （c）的空间mrna表达为大脑中已知的表达模式，主要在海马体中表达。图中结果显示了这两个基因在海马体中有显著表达，并且与已知的表达模式一致（注意：点大小不是按比例缩放）。

 10x genomics visium空间基因表达博天堂备用的解决方案还可以怎么玩？

如上图所示，将单细胞转录组数据和空间转录组数据进行锚定和整合，可获得目标组织的三维空间转录组图谱。
讲到这里，是不是心动了呢？趁现在研究的人还不算多，订购信息赶紧了解一下：

 visium空间基因表达博天堂备用的解决方案产品订购详细说明： 

1.在进行正式的空间转录组实验前，您需要购买货号为1000193的组织优化载玻片及试剂盒，可以优化四种组织类型的最佳通透时间，使得mrna 充分的释放。

2.随后，当您正式开始空间转录组实验时，您可以根据样本量的多少，选择购买做4个样本的kit(货号1000187)或者做16个样本的kit(货号1000184)。

3.此外您需要购买空间转录组配套的visium accessory kit(货号1000194)。

4.如果客户是第一次订购，建议您直接购买货号1000200的visium spatial gene expression starter kit,该试剂盒包括了货号1000193，1000184和1000194各一套，可以做16个样本。

5.上述试剂耗材可以帮我们进行空间转录组的捕获，当我们进行建库的时候，还需要订购货号为1000215的建库接头试剂盒。