ffpe 样本 | 空间转录组测序价格-博天堂备用

技术介绍   伯豪生物提供 ffpe 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务博天堂备用的解决方案

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空间转录组技术不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息，同时还能定位其在组织中的空间位置，对癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究来说都具有重要意义。目前该技术主要适用于新鲜冷冻组织样本，临床通常使用的 ffpe（福尔马林固定石蜡包埋）样本资源无法得到更加高效的应用。目前针对 ffpe 样本的空间基因表达博天堂备用的解决方案，可以从 ffpe 样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的空间表达信息。


技术优势   伯豪生物提供 ffpe 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务博天堂备用的解决方案

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1、打破对新鲜冰冻样本的局限性，使临床上大量的 ffpe 样本得到充分利用；
2、rna 模板连接（rtl) 探针集，具有高敏感性和特异性，且探针集覆盖了人和小鼠超过 18000 个基因；
3、可以结合更广泛的病理信息和预后信息，筛选生物标记物、进行回顾性和纵向研究，揭示更广泛更深入的生物学问题。

visium ffpe 实验流程    伯豪生物提供 ffpe 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务博天堂备用的解决方案

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样本要求   伯豪生物提供 ffpe 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务博天堂备用的解决方案

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1、满足组织贴片实验（不脱片）；
2、rna 完整性：dv200>50%。


数据分析    伯豪生物提供 ffpe 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务博天堂备用的解决方案

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通过生物信息分析直观地展示 spot 分群和 spot 亚群在组织切片上的空间分布以及差异基因的空间分布。此外，还提供高级分析、个性化分析等丰富的分析内容，包括单细胞数据与空转数据的联合分析等。

 

参考文献    伯豪生物提供 ffpe 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务博天堂备用的解决方案

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文章名称：tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer
发表时间：2022 年 3 月
发表期刊：immunity
影响因子：31.428
发表单位：法国索邦大学 cordeliers 研究院


伯豪生物客户项目发文     伯豪生物提供 ffpe 样本空间转录组测序、空间基因表达专业技术服务博天堂备用的解决方案

文章名称	杂志	if	发表年份
single-cell and spatial analysis reveal interaction of  fap fibroblasts and spp1 macrophages in  colorectal cancer	nature communications	17.694	2022
clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome	clinical and translational medicine	8.554	2022

 

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